南京是中国四大古都之一，是六朝古都，十朝都会。南航明故宫校区就坐落在明代皇城和宫城的区块内，是明代初年政治中枢的核心所在。校园和家属区分布在中轴线御道两侧，东侧校园是明代太庙建筑群，西侧家属区是社稷坛建筑群的位置所在，这个布局是严格按照《周礼》中记载的“左宗庙，右社稷”的要求来设计建筑的，反映的是古代社稷、宗庙、国家三位一体的关系。
2003年发现的水井就是明代太庙水井。发掘结束后，就对水井进行了保护。这次对水井做的维修保护工作，立足于考古发现，结合历史文献，参考同时期同类遗存，严格按照文物保护工作的要求，从项目立项、设计、实施，自始至终贯穿缜密严谨的科学精神，兢兢业业的工作态度，充盈饱满的工作热情，体现了南航人的责任担当和对历史遗产的敬畏，为我们竖立了一个榜样。
在《周易》中有《井卦》，赋井以德，井成为一种政治化、伦理化的象征。井水自地下浸润而出，泉源不息，滋养万物而不穷尽，体现出井的“所施不私”；井有常德，具有恒定之心，就是告诫人们要坚守信念，坚持原则，慎终如始，不忘初心，保持品性的中正高洁，以达到周万物，济天下的目标。大道无垠，上善若水，太庙水井之水，是源头活水，是上善之水。
明代太庙水井井栏于2020年修复完成，并且由校党委书记郑永安教授，中国工程院院士、校长单忠德教授共同揭牌，如今太庙井已成为南航校园重要的文化景观之一。